物理信息神经网络PINNs在布洛赫-托雷(Bloch-Torrey)方程上的应用求解 【torch案例】(Python代码实现)
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💥第一部分——内容介绍
基于物理信息神经网络求解布洛赫 - 托雷方程研究 ——PyTorch 实现案例
摘要
布洛赫 - 托雷方程是描述磁共振成像中自旋磁化强度时空演化、分子扩散弛豫行为的核心偏微分方程组,传统有限差分、有限元等数值求解方法存在网格剖分成本高、多参数反演迭代耗时、小样本临床数据适配性差等固有缺陷。物理信息神经网络(PINNs)将布洛赫 - 托雷方程对应的物理约束嵌入深度学习损失函数,无需密集离散网格,仅依靠少量观测信号数据即可同时完成方程正问题求解与组织弛豫、扩散系数等生理参数反演。本文以 PyTorch 深度学习框架为实现载体,系统性开展 PINNs 求解布洛赫 - 托雷方程的完整研究,梳理传统数值算法与纯数据驱动网络的局限性,构建适配磁共振时空耦合动力学的物理信息学习框架,分别完成仿真体模正向演化预测、多回波定量磁共振参数反演两大任务验证。对比传统最小二乘拟合、有限差分法与所提 PINNs 方案的精度、数据需求量、计算效率与抗噪性能,实验结果表明基于 PyTorch 搭建的 PINNs 框架具备极强小样本建模能力,在低信噪比稀疏采样磁共振信号下仍可输出满足物理一致性的磁化强度场分布与定量组织参数,为扩散加权成像、多参数定量磁共振重建提供轻量化、无网格新型求解范式。
关键词:物理信息神经网络;布洛赫 - 托雷方程;磁共振成像;定量参数反演;PyTorch;无网格数值求解
1 引言
1.1 研究背景与意义
磁共振成像依靠原子核自旋在外加射频脉冲、梯度场下的磁化矢量演化实现人体软组织无创成像,磁化强度随时间、空间的动态变化完全遵循布洛赫 - 托雷方程。相较于基础布洛赫常微分方程,布洛赫 - 托雷方程额外引入分子扩散项,可完整刻画扩散加权成像、灌注成像下水分子受限输运、T1/T2 弛豫衰减、空间梯度编码耦合的多物理耦合过程,是定量磁共振成像的底层数学模型。
临床与仿真场景中两类核心问题依赖该方程求解:一是正向仿真,给定组织扩散系数、弛豫时间、脉冲序列时序,预测任意空间位置与回波时刻的磁共振信号强度;二是逆向参数重建,基于扫描仪采集的稀疏多回波信号,反推每个体素对应的 T1、T2、表观扩散系数等组织特征参数。
传统数值求解方案高度依赖结构化网格离散,网格分辨率直接决定计算精度,三维人体组织仿真时网格规模急剧膨胀,单次迭代计算开销巨大;同时传统解析拟合方法针对特定脉冲序列推导简化信号模型,无法适配多梯度、多射频复合序列,泛化能力受限。近年来纯监督深度学习方案直接建立图像与参数映射关系,虽推理速度快,但完全脱离磁共振物理规律,在采样不足、噪声干扰场景下易生成违背自旋动力学的伪影,且模型缺乏可解释性,临床落地存在可信度瓶颈。
物理信息神经网络通过自动微分机制直接计算网络输出对时空变量的各阶导数,将布洛赫 - 托雷方程残差、初始磁化条件、边界磁场约束共同构建正则化损失,把偏微分方程求解转化为无监督 + 少量观测数据协同优化问题。依托 PyTorch 自动微分、动态计算图与轻量化硬件加速特性,可快速搭建适配三维时空耦合布洛赫 - 托雷方程的网络模型,无需专业有限元求解器,普通 GPU 即可完成正向仿真与多参数联合反演,大幅降低定量磁共振建模门槛,对脑部扩散成像、心肌灌注定量评估、病灶微结构参数检测具备重要工程应用价值。
1.2 国内外研究现状
1.2.1 布洛赫 - 托雷方程传统数值求解研究
早期针对布洛赫 - 托雷方程的求解以有限差分法、有限元法、格子玻尔兹曼方法为主流,通过均匀网格离散时空域,分步迭代求解弛豫、扩散、射频激励耦合项。该类方法成熟稳定,但存在三大短板:其一,人体组织非规则几何区域需复杂网格剖分流程,边界拟合难度高;其二,多参数反演需多次正向迭代仿真,计算成本随体素数量呈指数增长;其三,低采样、高噪声临床实测信号下,数值拟合易出现参数偏移,鲁棒性不足。现有商用磁共振仿真软件均基于网格数值算法,单次三维脑部仿真耗时可达数小时,难以满足实时参数重建需求。
1.2.2 PINNs 在磁共振布洛赫方程领域应用现状
物理信息神经网络自 2019 年提出后,逐步被引入磁共振物理建模领域,现有研究多聚焦无扩散项的基础布洛赫常微分方程,用于单序列 T2 映射、射频脉冲优化设计。针对含扩散项的布洛赫 - 托雷偏微分方程的 PINNs 研究仍处于起步阶段,现有工作存在明显局限:多数模型仅处理一维、二维简化时空模型,未适配三维人体成像空间域;框架多基于 TensorFlow 搭建,缺少面向工程人员的 PyTorch 轻量化实现方案;多数实验仅开展理想无噪声仿真数据验证,未覆盖临床低信噪比稀疏采样场景;同时现有研究未系统对比 PINNs 与传统数值算法在计算效率、参数误差、数据依赖度上的量化差异,缺乏完整正向 + 逆向联合验证体系。
1.2.3 当前研究存在的空白
综合现有文献,当前领域存在四点核心研究缺口:第一,缺少基于 PyTorch、完整适配三维时空耦合布洛赫 - 托雷方程的标准化 PINNs 实现框架;第二,现有模型未同步完成方程正向磁化场预测与多组织生理参数联合反演双任务验证;第三,缺少在稀疏采样、高斯噪声、不规则组织区域下 PINNs 与传统数值算法、最小二乘拟合的全面对比实验;第四,未针对布洛赫 - 托雷方程多物理项耦合导致的 PINNs 训练梯度失衡、收敛缓慢问题提出适配改进策略。本文围绕上述空白开展完整研究,搭建 PyTorch 基准案例,形成一套可复用的定量磁共振物理求解方案。
1.3 本文主要研究内容与章节安排
本文主要研究内容分为四部分:第一,系统分析布洛赫 - 托雷方程的物理耦合特性,明确传统数值算法与纯数据驱动模型的缺陷,阐述 PINNs 求解该方程的底层适配逻辑;第二,基于 PyTorch 构建面向布洛赫 - 托雷方程的专用物理信息神经网络框架,设计兼顾磁化矢量演化、扩散输运、弛豫衰减的复合损失函数,优化网络激活函数、配点采样策略以缓解多物理项梯度冲突;第三,设计两层验证实验,第一层为仿真体模正向求解实验,验证网络对时空磁化强度场的预测精度与无网格泛化能力,第二层为多回波磁共振信号逆向参数反演实验,完成 T2、表观扩散系数双参数同步重建;第四,从预测误差、数据需求量、计算耗时、抗噪性能四个维度,将所提 PyTorch-PINNs 方案与有限差分法、传统最小二乘拟合、普通全连接神经网络进行横向对比,分析所提方法优势与现存局限,并给出临床磁共振成像落地优化方向。
章节安排:第一章为绪论,阐述研究背景、现状与研究内容;第二章为基础理论与方法框架,介绍布洛赫 - 托雷方程物理内涵、PINNs 核心原理、PyTorch 框架适配优势;第三章为基于 PyTorch 的布洛赫 - 托雷 PINNs 模型设计,包含网络结构、损失函数构建、训练优化策略、数据集构建方案;第四章为仿真与对比实验,分正向求解、逆向参数反演两组实验开展结果分析;第五章为讨论,分析模型优势、现存问题与改进思路;第六章为结论与展望。
2 基础理论与整体方法框架
2.1 布洛赫 - 托雷方程物理内涵
布洛赫 - 托雷方程是耦合自旋弛豫、分子扩散、外加磁场激励的时空偏微分方程组,完整描述三维空间内任意位置原子核磁化强度矢量随时间的演化规律。相较于仅考虑弛豫与射频脉冲的基础布洛赫方程,其新增扩散拉普拉斯算子项,能够精准模拟扩散加权成像中水分子跨组织边界的受限扩散行为,是定量分析脑组织水肿、肿瘤微结构、心肌纤维化的核心物理模型。
方程内部存在多尺度耦合特性:时间维度包含微秒级射频脉冲激励、毫秒级弛豫衰减、秒级扩散输运;空间维度覆盖人体器官毫米级组织分辨率,同时存在不同组织边界处扩散系数突变的不连续特征。多尺度、多耦合、参数空间非线性耦合的特性,大幅提升传统数值求解难度,也是纯数据驱动网络易出现物理失真的核心原因。
正向求解任务输入为空间坐标、时间序列、组织固有参数(T1、T2、扩散系数)、脉冲梯度时序,输出三维磁化强度三分量时空分布;逆向任务输入为稀疏采样的多回波磁共振信号观测值,输出每个空间体素对应的弛豫、扩散生理参数,两类任务可统一通过 PINNs 框架实现求解。
2.2 物理信息神经网络核心求解逻辑
物理信息神经网络核心创新在于融合数据监督与物理方程先验约束,摒弃传统数值方法的网格离散流程,以全连接深度神经网络作为磁化强度场的连续近似函数。依托深度学习框架内置的自动微分工具,无需人工推导离散差分格式,可直接对网络输出关于空间、时间变量求导,代入布洛赫 - 托雷方程计算残差,将残差作为正则化项加入损失函数。
整体优化目标分为两部分:一是数据损失项,约束网络预测磁化强度与扫描仪实测或仿真观测信号保持一致;二是物理残差损失项,约束网络输出全程满足布洛赫 - 托雷动力学规律,同时叠加初始磁化条件、空间边界磁场约束作为附加损失。网络训练过程同步最小化两类损失,最终得到同时贴合观测数据、严格遵循磁共振物理规律的连续时空磁化场函数。
PINNs 天然适配布洛赫 - 托雷方程两大求解任务:正向求解时,组织生理参数作为已知常量嵌入物理残差,仅优化网络拟合磁化场;逆向参数反演时,将 T2、扩散系数等生理参数设置为可训练网络变量,与网络权重同步迭代优化,实现无额外迭代流程的多参数联合重建。
2.3 PyTorch 框架适配布洛赫 - 托雷方程求解的优势
本文选择 PyTorch 作为底层实现载体,相较于其他深度学习框架具备四点适配优势:第一,动态计算图机制支持随训练迭代动态调整时空配点采样策略,可自适应加密扩散系数突变区域的配点,提升边界求解精度;第二,自动微分接口简洁友好,可批量计算三维空间二阶扩散导数、时间一阶弛豫导数,完整适配布洛赫 - 托雷多阶偏微分耦合项;第三,原生支持 GPU/CPU 异构加速,无需复杂编译配置即可实现三维大规模时空配点并行计算,降低三维仿真耗时;第四,模块化编程特性可拆分网络主干、物理残差计算、观测数据加载、优化器调度四大模块,便于后续针对磁共振序列、人体组织模型进行模块替换与扩展,形成可复用标准化案例。
3 基于 PyTorch 的布洛赫 - 托雷 PINNs 模型整体设计
3.1 整体框架模块化设计
依托 PyTorch 面向对象编程范式,将完整求解框架划分为五大独立模块,模块间低耦合、可单独替换,形成标准化可复用案例体系:
- 时空域采样模块:负责三维空间坐标、时间回波序列、物理残差配点、观测数据采样点的批量生成,支持均匀采样、边界加密自适应采样两种模式,适配人体组织不规则空间区域;
- 深度近似网络主干模块:以全连接深度网络作为磁化矢量场近似器,针对布洛赫 - 托雷方程多尺度动力学特性选择适配激活函数,输入为三维空间坐标与时间,输出磁化强度三分量;逆向任务模式下新增可训练生理参数变量层;
- 布洛赫 - 托雷物理残差计算模块:基于 PyTorch 自动微分批量计算网络输出各阶时空导数,代入方程计算全域物理残差,同时附加初始磁化状态、空间边界磁场约束损失;
- 复合损失加权优化模块:融合观测数据损失、方程残差损失、边界约束损失,设置动态加权系数缓解多损失梯度失衡问题,内置 Adam、LBFGS 双层优化器调度逻辑;
- 结果存储与评估模块:训练过程中周期性导出磁化场预测结果、生理参数估计值、各类损失曲线,内置标准化误差评估指标,自动保存模型权重用于后续推理。
3.2 网络主干结构设计与优化策略
针对布洛赫 - 托雷方程时空耦合、多尺度演化特征,摒弃浅层网络,采用多层全连接深度网络作为磁化场近似器。网络输入维度统一为四维,包含三维空间坐标与单时间变量;输出维度为三维,对应磁化矢量三个正交分量。
训练过程中存在典型梯度冲突问题:弛豫项、扩散项、观测数据损失梯度量级差异较大,单一固定权重易导致某一类约束主导优化、其余约束失效。本文采用动态加权损失策略,每轮迭代根据各类损失当前均值自动调整权重系数,平衡数据拟合与物理约束的优化优先级,显著改善网络收敛稳定性。同时针对扩散项二阶导数计算易出现梯度消失问题,调整网络激活函数并采用残差连接结构,提升网络对空间高阶导数的拟合能力。
配点采样层面,默认采用拉丁超立方采样生成全域物理残差配点,针对组织边界、梯度场突变区域增设自适应加密配点,在不增加配点总量的前提下,大幅降低边界处磁化场预测误差,解决传统均匀采样在非均质组织区域求解精度不足的问题。
3.3 数据集构建方案
研究构建两类数据集分别支撑正向求解、逆向参数反演实验:
- 仿真体模数据集:基于传统有限差分法生成高精度基准磁化场数据,覆盖均匀均质体模、双组织边界体模两类场景,采样多回波时刻的磁化强度观测值,分别设置无噪声、5%、10%、15% 高斯噪声四组数据,用于验证模型抗噪性能;
- 临床模拟多回波数据集:模拟商用磁共振扫描仪多回波采集序列,仅保留少量稀疏观测采样点,模拟临床采集数据不足的真实场景,用于验证 PINNs 小样本参数反演能力。
所有数据集统一封装为 PyTorch 自定义数据集类,支持批量加载、随机打乱、采样点动态重采样,适配 GPU 并行训练流程。
3.4 训练流程整体规划
完整训练分为两阶段,均依托 PyTorch 优化器实现: 第一阶段为粗拟合阶段,采用 Adam 优化器快速下降损失,优先让网络初步贴合观测数据,降低初始磁化场预测偏差; 第二阶段为物理精细约束阶段,切换 LBFGS 优化器开展高精度局部寻优,强化布洛赫 - 托雷方程残差约束,修正第一阶段训练中出现的轻微物理失真,进一步降低全域求解误差。
训练过程实时记录数据损失、物理残差损失、边界损失变化曲线,设置早停机制,当连续多轮损失无明显下降时终止训练,避免过拟合;训练完成后保存完整网络权重与可训练生理参数,支持离线任意时空坐标磁化场快速推理。
4 仿真实验与结果分析
4.1 实验环境与对比基线设置
实验硬件采用单块中端 GPU 完成全部 PyTorch 模型训练与推理,对比基线选取三类主流求解方案:其一,有限差分法,作为磁化场正向求解高精度基准;其二,像素级最小二乘拟合,临床定量磁共振参数重建通用传统方法;其三,无物理约束普通全连接神经网络,纯数据驱动深度学习基线。
评价指标分为三类:磁化场预测采用平均绝对误差、峰值信噪比评估空间分布精度;生理参数反演采用参数相对误差评估定量重建准确度;性能指标包含模型训练耗时、完成单次全域推理耗时、所需最小观测采样点数,综合衡量各方案计算效率与数据依赖程度。
4.2 实验一:布洛赫 - 托雷方程正向时空磁化场求解
本实验目标为验证 PyTorch-PINNs 无网格正向仿真能力,给定固定组织弛豫、扩散参数,预测全时空域磁化强度分布,对比有限差分基准结果。
实验结果显示,在均质体模场景下,PINNs 预测磁化场与有限差分基准误差处于极低水平,磁化强度空间分布轮廓完全重合;在双组织边界非均质场景中,自适应加密配点策略有效捕捉扩散系数突变边界,未出现传统均匀采样模型常见的边界数值震荡。在不同噪声等级下,传统有限差分法观测数据噪声会直接传导至全域磁化场,而 PINNs 依靠布洛赫 - 托雷物理正则化约束,噪声对磁化场预测的干扰被显著抑制,峰值信噪比显著优于纯数据驱动网络。
计算效率层面,传统有限差分法需预先划分高密度网格,三维体模网格规模提升后计算耗时成倍增加;而 PyTorch-PINNs 属于无网格求解框架,推理阶段仅需输入任意离散时空坐标即可输出磁化强度,无需重新剖分网格,全域批量推理速度远高于有限差分迭代求解。同时 PINNs 仅需少量观测采样点即可完成全域连续场拟合,有限差分法则依赖密集网格数据,数据需求量差距显著。
4.3 实验二:基于布洛赫 - 托雷约束的多参数逆向反演
本实验模拟临床定量磁共振成像场景,仅提供稀疏多回波噪声观测信号,同步反演每个体素 T2 弛豫时间、表观扩散系数两类核心生理参数,对比最小二乘拟合与普通神经网络重建效果。
实验结果表明,在充足观测采样点条件下,三类方案参数反演误差差距较小;当观测采样数量削减至稀疏临床采集标准时,最小二乘拟合参数相对误差大幅上升,纯数据驱动网络出现大范围参数畸变,部分区域参数完全脱离生理合理区间;而 PyTorch-PINNs 依靠布洛赫 - 托雷方程作为强物理先验,即使采样量大幅减少,仍可稳定输出符合人体组织生理范围的参数映射图,参数相对误差远低于两类对比基线。
噪声鲁棒性测试结果显示,随着观测信号噪声强度提升,传统拟合方法与纯神经网络重建误差呈线性快速增长,PINNs 因物理残差约束限制参数无规则波动,误差增长幅度显著平缓,更适配临床低信噪比扫描数据。从可解释性角度分析,最小二乘与普通神经网络仅从像素灰度映射参数,无法保证信号演化符合磁共振动力学;PINNs 全程受布洛赫 - 托雷方程约束,每一组参数估计值均可对应生成满足物理规律的磁化强度演化曲线,具备更强临床可信度。
4.4 综合对比总结
综合两组实验全部量化指标,基于 PyTorch 搭建的 PINNs 框架在布洛赫 - 托雷方程求解任务中具备三项核心优势:一是小样本建模能力突出,稀疏采样临床数据下仍保持高精度求解;二是抗噪性能优异,物理正则化天然抑制观测噪声带来的磁化场畸变与参数偏移;三是无网格连续场输出,推理灵活、三维仿真计算效率优于传统数值网格算法。
同时实验也暴露现有模型局限:模型训练阶段迭代轮次较多,相较于纯数据网络训练耗时更长;针对超高分辨率全人体三维成像场景,全域配点总量提升会增加 GPU 显存占用;对于包含多组分、多扩散隔间的复杂微观组织模型,单一全连接网络近似高阶扩散动力学的拟合能力存在上限。
5 讨论
5.1 所提 PyTorch-PINNs 框架核心创新点
- 完整适配三维时空耦合布洛赫 - 托雷方程:现有多数 PINNs 磁共振研究仅处理一维、二维简化模型,本文搭建三维空间 + 时间四输入网络结构,完整覆盖扩散二阶偏导、弛豫一阶演化项,可直接用于脑部、心肌三维定量磁共振仿真;
- 标准化 PyTorch 模块化工程案例:拆解网络、物理残差、采样、优化、评估五大模块,无复杂第三方求解器依赖,仅依靠 PyTorch 原生接口实现全部功能,科研人员可快速修改模块适配不同磁共振脉冲序列;
- 动态加权损失与自适应配点双重优化:针对性解决布洛赫 - 托雷方程多物理项耦合导致的 PINNs 梯度失衡、边界求解精度不足两大行业共性难题,显著提升非均质组织模型求解稳定性;
- 正向仿真 + 逆向参数反演一体化框架:同一套网络结构切换训练模式即可完成两类核心磁共振任务,无需分别搭建两套模型,降低开发与维护成本。
5.2 与传统数值方法、纯深度学习方法的优劣对比
相较于有限差分、有限元等传统数值算法:优势为无网格、小样本适配、逆向多参数联合反演效率高、推理灵活;劣势为训练阶段迭代优化耗时更长,超高精度求解场景下收敛速度不及成熟数值离散算法。
相较于无物理约束纯监督神经网络:优势为物理一致性强、稀疏低噪数据鲁棒性高、模型具备可解释性、无需海量标注训练集;劣势为损失函数构造复杂,多损失平衡调参难度高于单一回归损失网络。
5.3 模型现存局限与改进方向
- 训练效率优化方向:可引入并行配点采样、傅里叶特征嵌入提升网络收敛速度,或采用算子学习预训练策略,减少从零训练所需迭代轮次;
- 复杂微观组织适配优化:针对多隔间扩散生物组织,可融合图神经网络构建空间分块 PINNs,区分不同组织区域单独拟合扩散动力学;
- 工程落地轻量化改进:训练完成后对 PyTorch 模型进行量化、剪枝压缩,部署至磁共振设备嵌入式 GPU,实现实时在线参数重建;
- 多物理场拓展:进一步叠加 B1 磁场不均匀、化学位移等干扰项,扩展布洛赫 - 托雷方程约束范围,适配更复杂真实临床扫描场景。
6 结论与未来展望
6.1 研究结论
本文以 PyTorch 深度学习框架为载体,构建面向布洛赫 - 托雷方程求解的标准化物理信息神经网络完整研究体系,系统阐述框架设计逻辑、训练优化策略,并通过正向磁化场仿真、多参数逆向重建两组对照实验完成全面验证。研究得出核心结论如下:
- 物理信息神经网络可有效克服传统网格数值算法依赖密集离散、反演迭代成本高的缺陷,依托布洛赫 - 托雷方程物理先验实现无网格连续时空磁化场求解;
- 基于 PyTorch 搭建的模块化 PINNs 框架自动微分能力可完整处理布洛赫 - 托雷方程弛豫、扩散耦合多阶偏导数,动态加权损失与自适应配点策略能够有效缓解多物理项梯度冲突,提升非均质组织边界求解精度;
- 相较于传统最小二乘拟合、纯数据驱动神经网络,该方案在稀疏采样、高噪声临床磁共振数据下具备显著精度优势,可同步稳定反演 T2、表观扩散系数等关键组织生理参数,且输出结果全程满足磁共振自旋动力学物理规律;
- PyTorch 动态计算图与 GPU 并行加速特性大幅降低三维布洛赫 - 托雷方程 PINNs 建模门槛,模块化架构便于针对不同成像序列、人体组织模型快速扩展,具备良好工程复用价值。
6.2 未来研究展望
后续研究可从三个方向延伸拓展:第一,融合卷积、图神经网络构建混合物理信息网络,提升复杂器官三维超高分辨率成像求解效率;第二,引入时变射频脉冲、梯度场作为网络输入参数,实现任意自定义磁共振序列的快速正向仿真与序列优化;第三,结合真实人体临床磁共振扫描数据开展体内实验,进一步验证模型在病灶定量诊断场景下的实用价值,推动物理信息神经网络从仿真研究落地为临床定量磁共振重建标准化工具。
📚第二部分——运行结果
下面这张图是解析解NMR信号 M(t)在不同L下的曲线.
(1) L=20情况
迭代50000次,基本收敛了.
NMR信号M(t)的模
NMR信号M(t)
🎉第三部分——参考文献
文章中一些内容引自网络,会注明出处或引用为参考文献,难免有未尽之处,如有不妥,请随时联系删除。(文章内容仅供参考,具体效果以运行结果为准)
🌈第四部分——本文完整资源下载
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